RUIZ PEREZ, JOSE FRANCISCO

Perfil en ORCID: 0000-0002-0039-3524

Perfil en ResearcherID: A-1651-2015

Perfil en Scopus: 7401444841\

Perfil en Dialnet: 3248618

Grupos de Investigación

• EXPRESION GENICA EN EUCARIONTES

Responsable de los siguientes proyectos/ayudas en la US

Proyectos:

• Bases Moleculares de la Formación de Translocaciones Cromosómicas Potencialmente Oncogénicas por Nhej. Papel y Regulación de las Polx Humanas ( BFU2013-44343-P ).
• Bases Moleculares de Enfermedades Neurodegenerativas Ligadas a Acumulación Proteica: Papel de la Reparación de Roturas en el ADN ( P11-CVI-7948 ).

Ayudas:

• Bases moleculares de las translocaciones cromosomicas potencialmente oncogenicas ( SOL2018-10807 ).
• INESTABILIDAD GENOMICA ASOCIADA A ROTURAS EN EL DNA ( SOL2017-8488 ).

Participa los siguientes proyectos/ayudas en la US

Proyectos:

• ROTURAS DE ADN ASOCIADAS A REPLICACIÓN Y REPARACIÓN POR RECOMBINACIÓN DE GENOMAS EUCARIÓTICOS ( BFU2010-16372 - Investigador/a).
• BASES GENETICAS Y MOLECULARES DEL ORIGEN DE LA INESTABILIDAD GENOMICA EN EUCARIOTAS ( P09-CVI-4567 - Investigador/a).
• GENOMICA FUNCIONAL DE LA INTERCONEXION TRANSCRIPCION-TRANSPORTE DE ARN ( P07-CVI-02549 - Investigador/a).
• BASES GENÉTICAS Y MOLECULARES DE LA INESTABILIDAD GENÓMICA Y SU RELACIÓN CON LA BIOGÉNESIS DE LOS MRNPS DE EUCARIOTAS ( BFU2006-05260 - Investigador/a).
• BASES GENÉTICAS Y MOLECULARES DEL ORIGEN DE LA INESTABILIDAD GENÉTICA EN EUCARIOTAS ( EXC/2005/CVI-624 - Investigador/a).
• CONSOLIDER INGENIO 2010: INESTABILIDAD GENÓMICA ( CDS2007-0015 - Investigador/a).

Ayudas:

• RAMON Y CAJAL CONVOCATORIA 2011 ( RYC2011-08752 - Investigador/a ).
• INESTABILIDAD GENOMICA ( BIO-102 - Investigador/a ).
• INESTABILIDAD GENOMICA ( BIO-102 - Investigador/a ).
• INESTABILIDAD GENOMICA ( BIO-102 - Investigador/a ).
• PLASTICIDAD Y FUNCION DE LOS GENOMAS ( CVI-102 - Investigador/a ).
• PLASTICIDAD Y FUNCIÓN DE LOS GENÓMAS ( CVI 0102 - Investigador/a ).

Publicaciones

Capítulo de Libros:

• Gómez-González, Belén, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Aguilera-Lopez, Andres:
  GENETIC AND MOLECULAR ANALYSIS OF MITOTIC RECOMBINATION IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE. Pag. 151 - 172. En: DNA RECOMBINATION. METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY. H. TSUBOUCHI. 2011. ISBN

Publicaciones en Revistas:

• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Yra1-bound RNA¿DNA hybrids cause orientation-independent transcription¿ replication collisions and telomere instability. En: Genes & Development. 2018. Vol. 32. Núm. . Pag. 1-13 http://www.genesdev.org/cgi/doi/10.1101/gad.311274.117.
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Identificada una nueva vía de regulación en la reparación de roturas de doble cadena en ADN de células humanas . En: Genética Médica News. 2017. Vol. 4. Núm. 76. Pag. 17-19
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Pol¿ tumor variants decrease the efficiency and accuracy of NH. En: Nucleic Acids Research. 2017. Vol. . Núm. . Pag. - https://doi.org/10.1093/nar/gkx625
• Sastre-moreno, G., Pryor, J.m, Herrero-ruiz, A., Cortes-Ledesma, Felipe, Blanco, L., Ramsden, D., Ruiz-Perez, Jose Francisco, Moreno, Marta:
  Regulation of human Pol¿ by ATM-mediated phosphorylation during non-homologous end joining. En: DNA Repair. 2017. Vol. 51. Núm. . Pag. 31-45 doi: 10.1016/j.dnarep.2017.01.004.
• Muñoz-Galvan, Sandra, Garcia-Rubio, Maria Luisa, Ortega, Pedro, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Jimeno-Gonzalez, Sonia, Pardo-, Benjamín, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  A new role for Rrm3 in repair of replication-born DNA breakage by sister chromatid recombination. En: PLoS Genetics. 2017. Vol. 13. Núm. 3. Pag. e1006781-
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7. Pag. 1-14 10.1371/journal.pgen.1003656
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Pardo-, Benjamín, Sastre-moreno, Guillermo, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco, Luis :
  Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations.. En: PLoS Genetics. 2013. Vol. 9. Núm. 7. Pag. e1003656-
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  AID INDUCES DOUBLE-STRAND BREAKS AT IMMUNOGLOBULIN SWITCH REGIONS AND C-MYC CAUSING CHROMOSOMAL TRANSLOCATIONS IN YEAST THO MUTANTS.. En: PLoS Genetics. 2011. Vol. 7. Núm. 2. Pag. E1002009-0
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  CHROMOSOMAL TRANSLOCATIONS CAUSED BY EITHER POL32-DEPENDANT OR INDEPENDANT TRIPARENTAL BREAK-INDUCED REPLICATION. En: Molecular and Cellular Biology. 2009. Vol. 29. Núm. 20. Pag. 5441-5454
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Al-,Et:
  POLYMERASE IS UP-REGULATED DURING THE T CELL-DEPENDENT IMMUNE RESPONSE AND ITS DEFICIENCY ALTERS DEVELOPMENTAL DYNAMICS OF SPLEEN CENTROBLASTS. En: European Journal of Immunology. 2005. Vol. 35. Núm. 5. Pag. 1601-1611
• Gonzalez-Barrera, Sergio, Autor-,Otro, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Blanco-Davila, Luis:
  CHARACTERIZATION OF SPPOL4, A UNIQUE X-FAMILY DNA POLYMERASE IN SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE. En: Nucleic Acids Research. 2005. Vol. 33. Núm. 15. Pag. 4762-4774
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Sáez-Castillo, Ana Isabel, Piris-, Miguel A., Blanco-Davila, Luis:
  OVEREXPRESSION OF HUMAN DNA POLYMERASE MU (POL MU) IN A BURKITT'S LYMPHOMA CELL LINE AFFECTS THE SOMATIC HYPERMUTATION RATE.. En: Nucleic Acids Research. 2004. Vol. 32. Núm. 19. Pag. 5861-5873
• Autor-,Otro, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Blanco-Davila, Luis:
  ARE THERE MUTATOR POLYMERASES?. En: The Scientific World Journal. 2003. Vol. 3. Núm. . Pag. 422-431
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Al-,Et:
  ¿LACK OF SUGAR DISCRIMINATION BY HUMAN POL ¿ REQUIRES A SINGLE GLYCINE RESIDUE¿. En: Nucleic Acids Research. 2003. Vol. 31. Núm. . Pag. 4441-4449
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Kunkel-,T. A., Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLYMERASE LAMBDA, A NOVEL DNA REPAIR ENZYME IN HUMAN CELLS. En: Journal of Biological Chemistry. 2002. Vol. 277. Núm. . Pag. 13184-13191
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLYMERASE MU (POL ¿), A CANDIDATE HYPERMUTASE?. En: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 2001. Vol. 356. Núm. . Pag. 99-109
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Mas, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLYMERASE LAMBDA (POL λ ), A NOVEL EUKARYOTIC DNA POLYMERASE WITH A POTENTIAL ROLE IN MEIOSIS MAMMALIAN MEIOTIC POLYMERASE. En: JMB: Journal of Molecular Biology. 2000. Vol. 301. Núm. . Pag. 851-857
• Autor-,Otro, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLYMERASE MU (), HOMOLOGOUS TO TDT, COULD ACT AS A DNA MUTATOR IN EUKARYOTIC CELLS. En: EMBO Journal. 2000. Vol. 19. Núm. . Pag. 1731-1742

Aportaciones a Congresos:

• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by ATM-mediated phosphorylation. Poster en Congreso. DNA Polymerases: from molecular function to human diseases. BIARRITZ. 2016
• Muñoz-Galvan, Sandra, Garcia-Rubio, Maria Luisa, Pardo-, Benjamín, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  New factor involved in recombination-mediated restart of broken forks. Ponencia en Congreso. Abcam-Mechanisms of Recombination 2016. Alicante, España. 2016
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Regulation of human Pol¿ by post-translational modification . Ponencia en Congreso. DNA Polymerases: from molecular function to human diseases. BIARRITZ. 2016
• Herrero-ruiz, A., Cortes-Ledesma, Felipe, Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) mediante SUMOilación durante la reparación del ADN. Poster en Congreso. XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Valencia. España. 2015
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Regulation of human DNA polymerase lambda during NHEJ by DNA-PK-mediated phosphorylation. Comunicación en congreso. IX Meeting of the Protein Structure and Function Network. Sevilla, España. 2015
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Regulación de la ADN polimerasa lambda humana (Pol¿) durante la reparación de DSBs or NHEJ mediante fosforilación dependiente de DNA-PKcs. Ponencia en Congreso. XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Valencia. España. 2015
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  DNA-PK-Mediated Phosphorylation of Human Pol Lambda During NHEJ. Ponencia en Congreso. Gordon Research Conferences on Mutagenesis. Girona. 2014
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Analysis of genetic instability in Mouse Embryonic Fibroblasts (MEFs) deficient in Polymerases lambda and mu. Poster en Congreso. Gordon Research Conferences on Mutagenesis. Girona. 2014
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  Yeast PolX DNA polymerase (Pol4) promotes NHEJ-dependent chromosomal translocations after DSBs induction. Poster en Congreso. Recombination Mechanisms and Genome Instability. Jerez, Spain. 2012
• Ruiz-Perez, Jose Francisco:
  A role for PolX DNA polymerases in NHEJ-mediated chromosomal translocations. Poster en Congreso. The enemy within: Endogenous DNA damage as a source of cancer and ageing. BAEZA, ESPAÑA. 2011
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  R-LOOP DEPENDANT TRANSCRIPTION IMPAIRMENT CAN RESULT IN DSBS AND CHROMOSOMAL TRANSLOCATIONS IN YEAST. Poster en Congreso. EMBO CONFERENCE SERIES ON RECOMBINATION AND CONNECTIONS TO SUMO AND UBIQUITIN MODIFICATIONS () (.2010.IL CIOCCO, ITALIA). IL CIOCCO, ITALIA. 2010
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Aguilera-Lopez, Andres:
  DSB-INDUCED CHROMOSOMAL REARRANGEMENTS. Conferencia Congreso no publicada. EMBO CONFERENCE SERIES ON RECOMBINATION MECHANISM () (.2008.IL CIOCCO, ITALIA). IL CIOCCO, ITALIA. 2008
• Gavaldá-Martín, Sandra, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Aguilera-Lopez, Andres:
  ANALYSIS OF REPLICATION FORK COLLISIONS WITH THE TRANSCRIPTION MACHINERY. Comunicación en congreso. SEBBM XXXI CONGRESO SOCIEDAD ESPAÑOLA DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR () (.2008.BILBAO, ESPAÑA). BILBAO, ESPAÑA. 2008
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  DSB-INDUCED TRIPARENTAL TRANSLOCATIONS MEDIATED BY BIR. Comunicación en congreso. CONFERENCES JACQUES MONOD ON BIOLOGICAL RESPONSES TO DNA DAMAGE () (.2008.ROSCOFF, FRANCIA). ROSCOFF, FRANCIA. 2008
• Gómez-González, Belén, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Moriel-Carretero, Maria, Felipe-Abrio, Irene, Aguilera-Lopez, Andres:
  TRANSCRIPTION AND RECOMBINATION MEDIATED GENETIC INSTABILITY IN S. CEREVISIAE. Conferencia Congreso no publicada. CNIO CANCER CONFERENCES. LINKS BETWEEN CANCER, REPLICATION STRESS AND GENOMIC INTEGRITY () (.2007.MADRID). . 2007
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Gómez-González, Belén, Aguilera-Lopez, Andres:
  TRIPARENTAL TRANSLOCATIONS GENERATED BY BREAK-INDUCED REPLICATION. Poster en Congreso. CNIO CANCER CONFERENCES. LINKS BETWEEN CANCER, REPLICATION STRESS AND GENOMIC INTEGRITY () (.2007.MADRID). . 2007
• Autor-,Otro, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  TEMPLATE DISLOCATION AND LACK OF SUGAR DISCRIMINATION, TWO HALLMARKS OF HUMAN POL MU THAT LIKELY SPECIFY ITS ROLE IN DNA REPAIR. Comunicación en congreso. ASM CONFERENCE ON DNA REPAIR & MUTAGENESIS: FROM MOLECULAR STRUCTURE TO BIOLOGICAL CONSEQUENCES () (.2004.SOUTHAMPTON, BERMUDA). SOUTHAMPTON, BERMUDA. 2004
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Aguilera-Lopez, Andres, Al-,Et:
  CHARACTERIZATION OF THE KO MODEL FOR DNA POLYMERASE ¿. EVIDENCE FOR A ROLE IN THE SHM PROCESS. Comunicación en congreso. GORDON RESEARCH CONFERENCE ON GENETIC TOXICOLOGY () (.2003.OXFORD, REINO UNIDO). OXFORD, REINO UNIDO. 2003
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  LACK OF SUGAR DISCRIMINATION BY HUMAN POL ¿ REQUIRES A SINGLE GLYCINE RESIDUE. Comunicación en congreso. GORDON RESEARCH CONFERENCE ON GENETIC TOXICOLOGY () (.2003.OXFORD, REINO UNIDO). OXFORD, REINO UNIDO. 2003
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLYMERASE MU, A CANDIDATE HYPERMUTASE?. Comunicación en congreso. GORDON RESEARCH CONFERENCE ON GENETIC TOXICOLOGY. 2001 () (.2001.NEW LONDON, NEW HAMPSHIRE, USA). NEW LONDON, NEW HAMPSHIRE, USA. 2001
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Mas, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLIMERASA LAMBDA (POL L), UNA NUEVA DNA POLIMERASA EUCARIÓTICA IMPLICADA EN MEIOSIS. Comunicación en congreso. XXIII CONGRESO DE LA SOCIEDAD ESPAÑOLA DE BIOQUIMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR () (.2000.GRANADA). GRANADA. 2000
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  DNA POLIMERASA MU (POL ¿), UN POTENCIAL MUTADOR DE DNA EN CÉLULAS EUCARIOTAS. Comunicación en congreso. XXIII CONGRESO DE LA SOCIEDAD ESPAÑOLA DE BIOQUIMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR () (.2000.GRANADA). GRANADA. 2000
• Autores-,Otros, Ruiz-Perez, Jose Francisco, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis, Autores-,Mas:
  DNA POLIMERASA LAMBDA (POL L) UN NUEVO ENZIMA DE REPARACIÓN EN CÉLULAS EUCARIÓTICAS. Comunicación en congreso. CONGRESO DE LA SEBBM (22.1999.PAMPLONA). PAMPLONA. 1999
• Ruiz-Perez, Jose Francisco, Autores-,Otros, Aguilera-Lopez, Andres, Blanco-Davila, Luis:
  CARACTERIZACIÓN DE UNA NUEVA DNA POLIMERASA EUCARIÓTICA, POSIBLEMENTE IMPLICADA EN HIPERMUTACIÓN SOMÁTICA. Comunicación en congreso. CONGRESO DE LA SEBBM (22.1999.PAMPLONA). PAMPLONA. 1999

Tesis dirigidas y co-dirigidas:

• :
  Polymerases specialized in damage tolerance and DNA double-strand break repair. Tesis Doctoral. 2016